横琴口岸位于珠海市横琴经济开发区十字门东南侧，与珠海莲花大桥相接，与澳门路氹隔海相望。珠海横琴口岸于2000年3月建成并投入使用。横琴口岸经过三期工程的建设，目前横琴过渡期口岸总建筑面积约4.2万平方米，占地24万平方米。主要建筑物有临时联检楼，内设出入境各16条人工验放通道和28条自助验放通道（其中出境16条，入境12条）。出入境客货车查验通道各10条，出入境货检场、报关楼及附属配套设施等。三期工程过渡期口岸于2014年12月18日建成并投入使用，2014年12月18日实行24小时通关，投资为65900万元。口岸的通关设计能力为旅客8万人次/日，车辆为2万辆次/日。目前横琴口岸的人流量日均为22361人次/日，车辆为2402辆次/日，为促进珠三角地区经济发展起到了重要的桥梁纽带作用。随着中国（广东）自由贸易试验区横琴新区片区的挂牌成立，并根据国务院批准通过的《横琴总体发展规划》有关创新通关制度的规定，按口岸的总体规划，横琴口岸实行分线管理，在横琴大桥设立二线通道。广珠城际轻轨横琴站将与澳门莲花口岸对接。今后横琴口岸将建设成以货运为主，大型物流与客流相匹配的大型客货运枢纽口岸。