盐田港水运口岸位于深圳大鹏湾海域西北部，南与香港九龙半岛隔海相望，分为盐田港区、下洞港区和广东大鹏液化天然气（LNG）专用码头，共有32个对外开放泊位。

　　（1）盐田港区。盐田港区于1990年6月经国务院批准对外国籍船舶开放，1994年7月正式开港。该港区位于距深圳市区13公里，距大鹏湾口12海里。岸边水深-15至-20米。由于大鹏半岛与九龙半岛天然的屏障掩护，湾内水深浪小，无淤积，大型船舶可以自由进出锚地，是少有的天然良港，并被列为中国沿海重点发展的四大国际深水港之一。

　　盐田港区划分为西、中、东三个港区，共有20个对外开放泊位。西港区建有4个集装箱泊位，可停泊2.5至15万吨级集装箱船舶。中港区建有大型集装箱专用泊位16个（其中16号泊位为15万吨级集装箱泊位），三期扩建工程10—15号新建泊位于2012年通过广东省口岸办组织的验收，广东省政府于同年10月17日批准上述6个集装箱专用泊位作为深圳港口岸盐田港区新增泊位正式对外开放。扩建工程16号泊位为15万吨级集装箱泊位，兼顾10万吨级、7万吨级集装箱船舶各1艘同时靠泊，新增年通过能力100万标准箱。16号泊位于2016年6月15日通过验收并于6月16日正式对外开放。

　　2017年，做好了协调盐田港西港区新建5号6号集装箱码头泊位的相关工作。盐田港西作业区集装箱码头工程项目经国家发改委核准，建设规模为新建4-6号泊位，共3个5万吨级集装箱泊位，扩建3号泊位，形成4个5万吨级集装箱泊位，以及建设相应配套设施，设计年通过能力为180万标准箱，码头岸线总长1142米，项目总投资383800万元。3号、4号泊位已先后建成投产，5号、6号泊位及配套工程已建设完工，计划于2018年初正式投入运营。

　　2017年，盐田港集装箱吞吐量1270.0万标准箱，同比增长8.6%。

　　（2）下洞港区。下洞港区位于大鹏湾畔，为深圳市东部石油、液化气等危险品码头专用作业区。2002年12月国务院批准下洞港区作为盐田水运口岸危险品作业区对外开放，港区内共建有3个独立的栈桥式码头共9个对开开庭泊位。

　　（3）广东大鹏液化天然气（LNG）专用码头。广东大鹏液化天然气（LNG）专用码头位于深圳东部大鹏半岛秤头角，是“十一•五”期间广东省口岸发展规划中主要建设项目之一。2007年3月经国务院批准盐田水运口岸大鹏液化天然气专用码头对外国籍船舶开放。LNG码头建有1个靠泊能力为8万吨级的LNG船专用的栈桥式码头泊位和1个5000吨级的工作船舶。

　　（4）深圳液化天然气专用码头。深圳液化天然气项目（迭福站址）是深圳市政府与中国海洋石油总公司战略合作重点内容，列入深圳市“十二五”能源基础设施重大建设项目。该项目位于深圳东部大鹏湾东北岸迭福片区，毗邻广东大鹏LNG项目，接收站占地约27公顷，项目总投资规模为80.7亿元，达产后天然气年周转量为400吨，项目配套建设1座可靠泊8-26.6万立方米LNG船舶的专用码头。2016年11月18日，深圳液化天然气专用码头通过了由省口岸办牵头组织的对外开放前准备工作验收，2016年11月21日对外开放。