深圳湾口岸自2007年7月1日开通以来，旅客出入境查验通道均设在旅检大楼一层大厅。
 
    旅检大楼原设计旅客通关流量为6万人次/天，截至2011年4月，通关旅客单日高峰已突破11万人，超过原设计的通关能力。
 
    为改善深圳湾口岸旅客通关环境，确保大运会期间参会人员快捷、安全的抵离口岸，经市政府同意，深圳湾口岸启动旅检大楼分层使用改造项目，由市口岸办作为项目前期单位、协调单位和使用单位，市建筑工务署作为建设单位，共同配合组织建设。深圳湾海关、检验检疫、边检各查验单位全力配合和支持。
 
    深圳湾口岸旅检大楼二层南行出境大厅改造工程从2011年2月18日动工，4月6日正式投入使用；旅检大楼一层大厅西侧由原来的南行出境改造为北行入境工程于5月24日完工并投入使用；一层东侧作为北行入境大厅改造工程于7月15日完工。
 
    市建筑工务署作为深圳湾口岸旅检大楼分层使用改造项目建设单位，施工期间与市口岸办保持了密切联系和沟通，精心组织施工，确保了工程按时完工。深圳湾海关、深圳湾边检、深圳湾检验检疫局、深圳湾管理处从大局出发，相互支持和配合，为迎大运工程顺利推进提供了保障。
 
    旅检大楼一层全部作为北行入境大厅投入使用，标志了深圳湾口岸旅检大楼分层使用改造工程项目全部完工，同时也标志了深圳湾口岸迎大运改造工程顺利完成。
 
    深圳湾口岸旅检大楼分层使用改造项目实施前，出境厅设10条人工验放通道、10条自助通道；入境厅也设10条人工验放通道、10条自助通道，共计出入境40条验放通道。旅检大楼分层使用改造工程项目完成后，一层北行入境大厅设人工验放通道26条，自助通道25条，合计51条入境通道；二层南行出境大厅设人工验放通道27条，自助通道25条，合计52条出境通道，共计出入境103条通道。
 
    旅检大楼旅客查验通道的增加，将极大地提高深圳湾口岸的通关能力，为大运期间参会人员的安全、快捷的抵离口岸提供了良好的通关条件。