2013年，连云港港集装箱铁水联运量受铁路运价上调、阿拉山口路径调整、西伯利亚陆桥分流等不利因素影响同比下滑；过境集装箱运输量得益于2012年底以来霍尔果斯过境班列的开通并保持稳定运行呈现较高增幅，同时呈现出由于霍尔果斯班列东西不对流带来的到发运量失衡问题。全年累计完成集装箱铁水联运量25.7万标箱，同比减少15.1%，其中发送量16.5标箱、到达量9.2万标箱，同比降幅分别为2.8%、30.9%；累计完成过境集装箱运输10.6万标箱，同比增长38.2%，其中发送量8.6万标箱、到达量2万标箱，同比分别增长58.9%、减少12.2%。

    2013年12月，港口完成集装箱铁水联运量2.1万标箱，同比减少5%，其中发送量1.4万标箱、到达量0.7万标箱，同比分别增长12.9%、减少29.6%；完成过境集装箱运输8694标箱，同比增长75%，其中发送量7402标箱、到达量1292标箱，同比分别增长100.3%、1.6%。