2003年度，海峡两岸共有10家船公司10艘船舶经营福州、厦门至高雄两岸间的集装箱班轮试点直航。一年来，两岸试点直航船公司共运营2002航次，比上年同期增长2%，共承运集装箱51.17万标箱，比上年同期下降4%，其中重箱34.27万标箱，空箱16.90万标箱。大陆6家船公司6艘船舶累计运营1204航次，比上年同期增长1%，共承运集装箱32.32万标箱，比上年同期下降6%，其中重箱21.30万标箱，空箱11.02万标箱；台湾4家船公司4艘船舶累计运营798航次，比上年同期增长3%，共承运集装箱18.85万标箱，比上年同期下降1%，其中重箱12.97万标箱，空箱5.88万标箱。大陆与台湾船舶总航次比为61:39，集装箱运量比为63:37。