现状：客流量已超设计流量3倍
据该口岸官员介绍，皇岗口岸始建于1989年，是国内最大的陆路边境口岸，在24小时通关和CEPA实施以后，它就成为我国有关人员和货柜车通行最频繁的重要口岸。
当年设计的日均客流量为5万人次，但在建成后，过境客流量一直呈上升态势。到目前为止，皇岗口岸日均客流量已达12万人次，最高时达15.8万人次，已超过设计客运能力的3倍，口岸边检、海关每天都派出人员在客运通道上疏导人流及车辆但都无济于事，该口岸狭小的旅检场地每天正承受着前所未有的压力。
隐患：口岸周边车辆人流混杂
深圳市政协委员黄小抗等人指出，由于其设计已不适应时代发展，在此背景下，该口岸周边集结了一些社会闲杂人员，滋生出不少混乱状况，小商店将本该庄重的出境大厅变成杂货铺门面，在出境大厅的门口，大批的旅游巴士、大小车辆停放在场外，人车混杂，存在重大事故隐患。
鉴于此，深圳市口岸办、深圳市交通局已于今年3月开始对此着手整治，由福田区委牵头成立联合执法部门，先后开展“霹雳”、“天网”、“拉网”等专项行动，在该口岸查获非法营运蓝牌车263辆、假的士12辆，清理大批违建。
据深圳市口岸办主任曹绍业介绍，目前深圳正在实施5大跨境工程，该工程的实施将有力缓解这一被动局面，，五大工程均为跨境工程，各工程的实施将使通关能力和速度提高数倍。
其中，皇岗－落马洲口岸第二公路桥、罗湖人行天桥改造工程项目、沙头角口岸新公路桥计划于今年年底建成投入使用，皇岗口岸地铁工程由皇岗－落马洲人行通道桥和皇岗－落马洲地铁口岸联检楼两个工程组成，香港部分将接驳轻轨，整个口岸将于2006年年底前建成使用。
西部通道工程总造价近38亿元，其中包括深圳湾公路大桥、一线口岸、口岸区填海以及接线工程四项内容。经深港双方共同商定，西部通道工程原计划在2005年年底建成主体工程。目前口岸区填海工程已于2002年4月开工，目前一线口岸的设计工程已全面展开，已完成了监管区场地、货检场地以及旅检大楼的初步设计。
