据广东出入境检验检疫局介绍，在合作框架协议下，该局将致力于完善泛珠三角区域 检验检疫协作机制，全力支持合作框架下的重点工程、重点项目建设，强化合作区域国境口岸热带传染病防治工作等。这八项措施主要是进一步加快信息化工作步伐，全力推进检验检疫监督管理电子化，把出入境检验检疫电子监管系统与电子审单快速核放系统、海港口岸快速查验系统有机结合起来，进一步简化手续，缩短检验周期，确保广东等地区庞大的物流人流快进快出。
完善泛珠三角区域检验检疫协作机制，提高口岸检验检疫验放速度；完善合作区域内出境货物“产地检验、口岸查验”的业务协作机制，实现报检单位注册登记电子数据共享；开辟货物快速验放通道，使泛珠三角地区更多实施绿色通道制度企业的出口产品通过产地检验之后，免于口岸查验，直接办理换证通关。
进一步完善九省二区的疫情防治机制、疾病监测预警机制和反应网络，在南方八省市检验检疫热带病卫生检疫联防组的基础上，扩大合作范围，强化合作区域国境口岸热带传染病的防治工作。加强动植物疫情疫病监控，维护农业生产安全，力促农产品扩大出口。积极收集九省间外来有害生物尤其是外来检疫性有害生物的截获、发生信息资料，对国内外动植物疫情做到及时发现、及时反馈、及时控制，并及时指导有关企业应对贸易技术壁垒。加大检验检疫执法力度，创建公平的市场环境。本着逐步开放、规范管理的原则，加强对国际认证和报检中介代理机构的监督管理，认真清理整顿认证机构、咨询机构、代理报检机构和社会中介检验机构，对于不具备资格条件的、违法经营的依法予以查处。大力加强科技合作与交流，努力提升检测水平。在现有与九省二区科技项目合作的基础上，重点加强对ＳＡＲＳ监测和防治的科技合作，加强经香港进口的水果、植物种苗等植物产品检验检疫技术合作及禽流感、口蹄疫、疯牛病等疫情监测的科研合作。
