据介绍，进境动植物检验检疫网上审批自2004年9月1日实施以来，运行良好。此系统的运行，大大提高了审批速度。以往审批通过手工操作加上邮局寄送时间，一个申请单需20多天才能领到许可证，而现在只需10天左右，申请人就能到直属局领取许可证，大大提高了工作效率，促进了外贸的发展。
此外，为了契合《行政许可法》指导思想，该系统增加了“受理决定书”和“不受理决定书”；填写表格不规范或需补材料等情况能及时反馈到用户。同时，申请用户通过查询系统随时可以查询申请单的办理状态，也大大增加了审批工作的透明度。据悉，厦门局是国家质检总局“动植物检验检疫网上审批系统”第二期试点单位之一。
