据介绍，南京口岸拥有南京港、南京禄口国际机场两个国家一类海港、空港口岸。此外，我市还设立了四个一类口岸延伸点即四个陆路延伸口岸：位于南京火车西站的铁路海关监管点、王家湾直通式海关监管点、南京出口加工区和南京出口加工区（南区），形成了集海、陆、空于一体的全方位立体口岸。
南京港是我国内河最大的港口，可与世界各大洲相连，目前南京港中转的进出口货物对外辐射至76个国家和地区的180多个港口，2004年，南京港实现货物吞吐量达1．18亿吨，成为全国内河第一个亿吨港；南京禄口国际机场目前已开通了国内、外（地区）53个城市的85条航线，2004年，南京禄口国际机场实现旅客吞吐量457．4万人次，出入境人员42．3万人次，货邮吞吐量13．98万吨，国际（地区）货运量4．95万吨，成为名列上海、北京、广州、深圳之后的全国第五大国际货运机场；2004年铁路实现外贸集装箱吞吐量2039标箱，进出口车皮2187节；公路实现外贸集装箱吞吐量5470标箱；出口加工区（南区）完成进出口货物8．8亿美元。
