张家港海关自行设计、联合开发的“保税区物流信息化管理系统”自2002年6月投入运行以来，经过三年多的推广应用，保税区所有加工企业、仓储企业和报关公司都使用该系统办理海关业务和手续。随着时间的推移，针对保税区日益增多的业务模式，不断增强的业务需求和计算机信息技术的发展，提出了升级改造的任务并于日前成功进行升级。新系统进一步加强了统计预警功能，更好地实现了海关对保税区“一线放开、二线管住、区内宽松”的管理要求，与保税物流园区更好地实现了业务功能和数据对接，对开展“区港联动”具有重要意义。