2003年,马尾海关监管的对台小额贸易船舶仅有74艘次,进口货物515吨,货值137万美元。随着两岸经贸往来的密切和繁荣,马尾口岸对台小额贸易业务也随之快速发展起来,台资企业进口用于维修的设备配套件和机器零配件也越来越多,通常每批进口的货物多达几十甚至上百种。2004年,马尾海关共监管对台小额贸易船舶398艘次,比2003年增长4倍;进口货物4576吨,增长8倍;货值827万美元,增长5倍。