2009年2月2日，NBCT年度疏浚工程如期开工，本次疏浚范围为码头405m--1325m，前沿6米内疏浚至-13.5米，6米外疏浚至-14.5米，码头东端浅滩，疏浚范围至码头外40米处止。该疏浚方案既保证了码头下部淤积坡度在码头安全许可范围内，又最大程度的拓展了码头前沿水深，为码头靠泊较大集装箱船舶提供了水深保障。截止2009年2月13日本次疏浚工作已基本完成。