为进一提升服务水平和更好地服务客户需要，常州海关直通点首次尝试直接为外商服务的全程保税物流操作，加强了常州水路、陆路口岸联动，提高了口岸整合效能，促进了进口贸易方式多元化。

    2009年3月31日, 常州海关直通点迎来国外首批全程代理进口棉花的业务。为认真做好这单业务，常州海关直通点多次与国外客户瑞士・赖因哈特公司协商、探讨，签定了全程保税代理协议，由直通点全面负责与海关、商检等政府机构及中外运、港口、船代等相关物流企业的沟通和衔接，为国外客户提供包括货物至常州港后的进口货代、出入库报关、报检、装卸、保税仓储管理等一站式的全程物流服务并直接对国外客户及其银行负责。这单由非洲贝宁直接发往常州港的首批共8个40尺集装箱200余吨非洲棉，由上海港中转抵达常州港口，经办理换单、检疫、报关等手续，于4月7日陆续运往常州海关直通点，顺利卸货存入保税仓库。

    全程保税物流操作模式是国内进出口物流发展的新主流，为众多世界知名跨国公司及进出口吞吐量较大的企业所广泛采用。常州直通点这次尝试的全程保税物流操作，还有别于一般保税物流操作。进口货物的一般保税物流操作，是由国内购货商将已购买的进口货物经上海转关至常州后进行保税仓储。而这次直通点的作业是直接服务于国外供货商，为国外供货商的待销货物直接送到常州保税仓库提供物流服务，促进了常州进口贸易方式的多样化发展。