2009年，台州口岸出入境船舶总计2818艘次，同比增加164.7%，创下台州口岸历史新高。其中大麦屿港出入境煤船同比增加234.4%，同时还临时开通了12航次的大麦屿港至台湾基隆港的海上客运航线。
 
    台州口岸出入境船舶主要运输可回收利用废旧金属和煤炭，随着2009年全球经济逐渐回暖，国际贸易日益活跃，以及由于金融危机带来各种运费、货物单价的下降，台州口岸船舶的总量反而有所增加，出入境船舶总量呈现大幅上升的势头。一是开通两岸临时直航，新增了大麦屿港至台湾基隆港的客运航线；二是随着玉环华能电厂发电规模扩大，电煤进口量大增；三是受国际贸易的影响，日本、韩国各港口至海门港的运输可用作原料的固体废物船舶数量增加，特别是出境船舶的数量剧增，直接形成了2009年出入境船舶数量创历史新高的局面；四是台州局科学处理防控甲流与经济发展的关系，努力确保台州口岸畅通，在坚持原有服务举措同时，自觉延长工作时间，实行24小时值班制度、无节假日的轮班工作制，缩短进境船舶检疫查验时间，提高检验检疫效率，确保进境船舶在严格检疫下尽早卸货，减轻了企业负担，提高了台州口岸的竞争力。